O deputado deu início ao processo de desfiliação em maio, somente recentemente foi confirmada. “Estava me sentindo isolado. Não participei de nenhum programa do PR na televisão. Fui vetado. O partido ainda ameaçou punir a mim e ao deputado Raimundo Louro se ficássemos no Bloquinho (Bloco União Democrática). Acho que não podemos fuçar em um casamento onde as coisas não estão dando certo”, declarou Jota Pinto.
A principal insatisfação do deputado foi a aliança do partido com a candidatura de Tadeu Palácio (PP) nas eleições de São Luís. A aliança foi tratada pelo deputado Davi Alves Silva Júnior (presidente da legenda no Maranhão).